Финансовый университет является одним из немногих вузов Российской Федерации, где действует совет (Д 505.001.105) по специальности 08.00.01 – Экономическая теория. Профили (специализации) совета: «Политическая экономия. Институциональная и эволюционная экономическая теория» и «Микроэкономическая и макроэкономическая теория»
Основа работы в аспирантуре – это глубокий, личный, профессиональный контакт аспиранта с научным руководителем. Подбор научного руководителя осуществляется исходя из близости сферы научных интересов руководителя и избранной аспирантом темы диссертационного исследования. Таким образом, в лице научного руководителя аспирант получает и старшего коллегу с неизмеримо более широким, чем у него самого, общеэкономическим кругозором, и профессионала, в деталях разбирающегося в той конкретной области, которую он собирается изучить.
В программе заняты исключительно лучшие кадры департамента. Среди них ведущие ученые-представители научных школ, авторы учебников и научных трудов: Нуреев Р.М., д.э.н., профессор, Научный руководитель Департамента экономической теории, Толкачев С.А., д.э.н., профессор, Первый заместитель руководителя Департамента экономической теории, Альпидовская М.Л., д.э.н., профессор, Дементьев В.В., д.э.н., профессор, Карамова О.В., д.э.н., профессор, Колодняя Г.В., д.э.н., профессор, Ореховский П.А., д.э.н., профессор, Пивоварова М.А., д.э.н., профессор, Цхададзе Н.В., д.э.н., профессор, Юданов А.Ю., д.э.н., профессор, Ядгаров Я.С., д.э.н., профессор.